碳源不足導致生化處理單元的脫氮除磷效果不能達到理想狀態，從而影響出水水質的穩定。生物脫氮，是反硝化細菌利用亞硝化細菌和硝化細菌聯合作用生成的硝酸鹽混合液，在缺氧條件下分解碳源產生的能量，將硝酸鹽轉換成氮氣；生物除磷，是聚磷菌在厭氧條件下分解進水中的碳源等營養物質合成自身的能量同時釋放體內的磷，再在好氧條件下利用合成的能量超量吸收磷，通過排除剩余污泥，達到除磷的效果。生物脫氮除磷過程中都需要使用碳源等營養物質實現能量的生成，而進水碳源的不足，將影響脫氮除磷最佳效果的實現。所以在整個污水處理廠凈化處理中，碳源的選擇和投加對于整個污水處理廠凈化處理效果提升是很有必要的，只有保障了碳源選擇正確和有效投加，才能將整體的污水處理凈化效果提升。
碳源投加選擇
常用的外加碳源有甲醇、乙酸、酒業廢水、乙酸鹽、淀粉、葡萄糖和醋酸鈉等。2020年開始常用的外加碳源的被復合碳源代替。
不同的外加碳源在反應性能以及反應條件的應用上都存在差別，要想保障整體的碳源投加效果，應選擇合適的碳源，確定高效且經濟合理的投加量。
碳源的選擇對于整個污水處理廠凈化效果提升具有重要影響。通過對進水水質的檢測，了解進水中碳源等有機物的含量，從而分析進水碳源對生物脫氮除磷的基本影響，為后續碳源的投加提供初步參考。