添加碳源的目的是除氮，但考慮到脫氮效果，也要兼顧污水處理廠的穩定運行，避免處理成本的增加。
1、污泥產量。
首先，添加碳源肯定會增加污泥產量，而且污泥處理成本很高。在常用的碳源中，乙酸和乙酸鈉價格昂貴，污泥產量高，會給污水處理廠的污泥處置帶來一定的壓力。以葡萄糖為代表的糖作為外部碳源，使 得脫氮效果良好。然而，糖作為一種多分子化合物，容易引起大量細菌，導致污泥膨脹。
2、出水COD值和亞硝基氮積累
次之，一些碳源的加入也會影響出水COD值和亞硝基氮積累。以糖為碳源會增加出水COD值，影響出水水 質。同時，與酒精碳源相比，更容易產生亞硝酸鹽氮積累。甲醇作為外部碳源，具有運行成本低、污泥 產率低的優點，但當甲醇的碳源不足時，會出現亞硝酸鹽積累的現象。另外，如果投加量控制不好，或 者系統進水變化波動太大，很容易造成生化系統中毒，好氧區絲狀菌膨脹。
復合碳源推薦
生物利用率高，促進反硝化脫氮異養菌群的快速繁殖；
有效COD含量高，針對反硝化細菌專一定制，性價比普遍優于甲醇、乙醇、淀粉、葡萄糖、乙酸及乙酸鈉 等傳統碳源；