在城市污水處理廠的實際運行中，優選碳源時應注意以下幾點：(1)深入了解不同碳源的特性，結合具體的進水水質特點，選擇最佳碳源，具體問題具體分析，切忌照搬;(2)可開發利用的碳源種類很多，但考慮到污水處理廠的運行成本，并注意選擇可操控性強的碳源，做到經濟性和高效性的統一;(3)根據不同碳源的不同性質，還可考慮同時利用多種碳源，做到內、外碳源有機結合，以達到最佳脫氮除磷效果;(4)進一步優化城市污水處理廠的處理工藝和運行參數，提高運行管理水平，最大限度提高整個流程的處理效率。
污水處理的厭氧池，缺氧池和好氧池在日常運行中為了補充碳源，選擇外加碳源，現在如今常用的碳源包括甲醇、乙醇、乙酸、乙酸鈉等液態有機物及糖類;(2)其他類型的碳源，如工業廢水、垃圾滲濾液。
一般加在厭氧和好氧系統里。就厭氧而言，主要考慮因素為酸化程度，進水COD，反應在指標上即PH,VFA，COD。COD一般不用考慮，這在均質池(綜合調節池)就可以調節的。要根據進水水質情況來決定加多少。一般是加在進生化池前，用水溶解后加入。好氧而言，在不缺少BOD的情況下是不需要加的，缺少的話就要加了，因為缺少BOD的情況下，容易會產生硝化。
為了提供碳源，這是為了更好的培養細菌，提高污水的可生化性。污水處理中作為污泥營養源，若運行的系統中COD、BOD不足以供給菌種生長繁殖的話，就需要另外投加，以防污泥老化，生物活性降低。
主要用于生產廢水的脫氮除磷，在用以提高城市污水處理廠的脫氮除磷效率的應用環節上有待進一步的探討。