1、甲醇
甲醇易燃，為甲類危化品，使用和儲存均有嚴格要求。
使用甲醇必須取得危險品使用許可證，并配有相關防爆設備，因此固定資產投資大，后期運維成本高。同時，使用甲醇的企業揮發性有機化合物很難達標，受政府部門監管成本高。
更重要的是，企業要想儲存甲醇需報當地公安部門備案審批，手續繁瑣，儲存量超過一定數值，屬于重大危險源。
2、乙酸
乙酸為乙類危化品，也是揮發性酸，是大氣污染揮發性有機化合物的重要組成部分，環保部門監管多，儲存條件要求高。多數污水處理廠遠離乙酸廠，運輸費用高。
3、乙酸鈉
乙酸鈉多為20%、25%、30%的液體，人工配置藥劑工作量大。同時，由于當量COD低，運輸費用高，不能遠距離運輸。
4、糖類
糖類外加碳源，需要現場配置成溶液，勞動強度大，勞動成本高。
外加碳源去除污水中氮磷的效果也有一定差異，但在反硝化過程中，能夠快速被生物降解、不會產生二次污染的碳源是反硝化過程中電子供體的最佳選擇。