在污水處理領域有著廣泛的應用。在微生物脫氮方面，進行反硝化作用時，異養反硝化菌需消耗做為碳源并提供能量的外加有機物。
可以通過向缺氧區投加外碳源，以補充碳源的方式提高反硝化速率。不同外碳源對系統的反硝化過程影響不同，即使外碳源投加量相同，處理效果也不同。
在污水處理中的優勢是：
1.生物利用率高，促進反硝化脫氮除磷異養菌群的快速繁殖。
2.有效 COD 含量高，針對反硝化細菌專一定制，性價比普遍優于甲醇、乙醇、乙酸及乙酸鈉等傳統碳源。
3.無毒無害、生物友好、存儲使用安全不易燃易爆炸。
4、具有低溫不結晶，流動性好，用量易控制。
5、減少卸車、投料勞動力成本。
6.相對于固體碳源，液體復合碳源由于減少加工工序價格便宜，減少污水處理運行成本。
復合碳源藥劑在應用時主要用于城市污水、工業廢水的處理。在廢水處理時根據藥劑性質和水體污染程度將原液稀釋到相應濃度后投加，對于污染嚴重的廢水可選擇原藥直接投加的方式。
復合碳源藥劑外加碳源藥劑的優點，化學性質穩定，反硝化速率快，污泥產量低，污泥菌種適應快，脫氮效果好，處理成本低于其他幾種常規碳源藥劑，適用于污水廠的應急投加處理，滿足水質排放要求的同時達到經濟效果。
復合碳源藥劑可以替代傳統外加碳源藥劑，避免了傳統碳源藥劑的高成本、高風險問題，大大提升了脫氮效率，降低了處理成本和污泥產量。