化工含磷廢水使水體中含磷量增加，從到導致水體富營養化。具體來講，對水體的危害如下：①使水體腥臭難聞；②降低水體的透明度；③降低水體中的溶解氧含量；④向水體釋放有毒物質；⑤影響供水水質并增加制水成本；⑥影響水生生態環境。
含磷廢水處理方法
化學沉淀法
化學沉淀法是指用化學除磷試劑和污水中的磷反應，使化學除磷試劑和磷酸鹽發送化學沉淀，最后生成不溶于水的磷酸鹽沉淀物，從而達到除磷的目的。
電解法
電解法裝置簡單，控制容易，電解法常采用銅、鋁、鐵等材料做電極，以去除污水中的磷。
生物法
生物法除磷是利用嗜磷菌在好氧和厭氧環境下，過量攝取及釋放磷的原理，通過厭氧好氧條件的交替來實現磷的去除。
吸附法
當流體與多孔固體接觸時，流體中某一組分或多個組分在固體表面處產生積蓄。吸附法也能有效的去除廢水中多種污染物。