碳源是有機物，投加量大，水中溶解氧不足，水體缺氧污泥上浮，絲狀菌膨脹，氨氮超標。而投加量不足則會造成反硝化反應弱，總氮超標。
如復合碳源等外加碳源一般投加于廢水深度處理的反硝化生化濾池或反硝化缺氧池/厭氧池入水口。如A2O工藝中，通常是投加于第2個A段的進水口。投加量可按C:N:P=100:5:1的比例投加碳源。
如采用加藥管投加點投加碳源，需要充分考慮內回流的硝化液中的溶解氧的影響，不要直接放置于硝化液回流點的位置。溶解氧較高時，投加的碳源容易被異養菌和反硝化兼性菌的利用掉，進入反硝化作用的碳源量減少，除了曝氣外，跌水曝氣也會增加水中的溶解氧，因此，碳源投加點直接投加在回流點的位置上，可能會造成碳源的好氧狀態下損失，增加反硝化所需的碳源投加量和成本。盡量避開回流點平行區域。因此，復合碳源可投加于內回流點位下游的3-5m（反硝化區較小時，可縮減到2-3米）。同時還要注意規避水力死角。
碳源投加對脫氮效果有什么影響
理論上要求反硝化池中C/N為2.86，可達到脫氮效果。實際上加上微生物自身新陳代謝需要，C/N比一般要調到4以上。這是由于正常情況下，反硝化菌需要在消耗完回流攜帶的氧氣后才進入反硝化反應，而在消耗這部分氧氣的過程中需要消耗水中的碳源，因此，AO脫氮工藝的C/N需要大于4（一般在4-6）才能真正滿足反硝化菌脫氮所需。 碳源是微生物營養劑，一般來說污水中也會存在碳源，但在反硝化脫氮中，通常是氮多，碳少，不足以維持反硝化菌的正常脫氮所需。因此需要補充外來碳源。比如我們前面所說的復合碳源。