現在的污水處理時越來越多使用到微生物。在污水里投放大量有效微生物菌種如反硝化細菌，促使水體本身快速形成一個平衡的生態系統，其中不僅有分解者生物、生產者生物、還有消費者生物，三者分工協作，對污水中的污染物能進行更有效的處理和利用。一些無機化合物作為碳源、氮源和磷源，以太陽能為初始能源，參與食物網中的新陳代謝過程，并從低營養級到高營養級逐級遷移轉化，最后轉變成水生作物、魚、蝦、蚌、鵝、鴨等高級的生命體產物,而且通過人們的不斷的取走和加入的措施來保持水體的綜合生態平衡，增加水景的美觀自然，達到防治水體的富營養化的目的。以原污水中的含碳有機物和內源代謝產物為碳源，節省了投加外碳源的費用。
反硝化的過程其實也就是個脫氮的過程。反硝化細菌在缺氧條件下可以釋放氮。能進行反硝化作用的只有少數細菌。由于反硝化細菌也需要有營養供給，充足的碳源至關重要了。在需要脫氮的污水中，往往是碳源不足導致反硝化的去除率低，導致出水TN超標，所以外加碳源成為了目前唯一適用于實踐的手段，目前碳源一般有甲醇、乙酸鈉、面粉、葡萄糖等。不同的碳源效果作用也不盡相同。
很多人都認為甲醇作為外碳源具有運行費用低和污泥產量小的優勢。但在甲醇碳源不足時，存在亞硝酸鹽積累的現象。以甲醇為碳源時的反硝化速率比以葡萄糖為碳源時快3倍，最佳碳氮比為2.8～3.2。
其次乙酸鈉的優點在于它能立即響應反硝化過程，能用作水廠運行時的應急處理。乙酸鈉由于是小分子有機酸的原因，反硝化菌易于利用，脫氮效果是最好的。但是，由于價格較為昂貴，污泥產率高，且目前污水廠的污泥處置問題也是一個較大的攻關難題。
再者有污泥水解上清液，生物轉化VFA來源于污泥水解的上清液，由于水解所產生的VFA擁有很高的反硝化速率，碳源可以直接由污水廠內部提供，在污泥減容的同時還減少了碳源運輸方面的問題，所以它是目前比較有優勢的碳源?？墒菍τ诓煌奈勰?，不同的水解條件，所產生的污泥中VFA的成分有較大的差別，而由于成分不同，又能引起反硝化速率的不同。除此以外，若直接將水解污泥作為外碳源，還要考慮到污泥水解過程中氮磷的釋放問題，這部分氮磷若以碳源的形式投加到污水中，勢必會增加污水處理廠的氮磷負荷。碳源還有糖類物質主要以面粉、蔗糖、葡萄糖為主，由于葡萄糖是最簡單的糖，所以目前研究比較多。當碳源充足時，以葡萄糖為碳源的最佳碳氮比較甲醇為碳源時高得多，為6∶1～7∶1。以葡萄糖為代表的糖類物質作為外加碳源處理效果不錯，它作為一種多分子化合物，容易引起細菌的大量繁殖，導致污泥膨脹，增加出水中COD的值，影響出水水質，同時，與醇類碳源相比，糖類物質更容易產生亞硝態氮積累的現象。
微生物的代謝需要一定比例的營養物質，除以BOD5表示的碳源外，還需要氧、磷和其它元素。其BOD5∶N∶P=100∶5∶1是微生物的最佳營養比例。合理使用好碳源等外在助力對于污水處理的效果也會更好。反硝化細菌的使用也更好的表明了微生物在污水處理領域的重要作用。群林生物2001年開始致力微生物的研究還與華中農業科技院校強強合作。大品牌值得信賴。
