由于后置反硝化濾池進水的BOD所剩無幾，因此必須要向濾池投加碳源，以保證反硝化細菌有足夠的能量源。
我們說的碳源，在工程實踐中一般是指的是COD(化學需氧量)，而CN比中的N，沒有特殊情況(進水有機氮很少)下是指NH3-N(氨氮)，即所謂C/N實際為COD/NH3-N，COD是用需氧量來衡量有機物含量的一種方法，如甲醇氧化的過程可用(1)式所示，二者并不相同，但二者按照比例增加，有機物越多，需氧量也越多。因此，我們可以用COD來表征有機物的變化。
正常情況下，反硝化菌只有在消耗完內回流攜帶的氧氣之后才進行反硝化，所有，這一部分的氧氣也是消耗了碳源。
反硝化生物濾池能去除部分氨氮,主要是進水的溶解氧較高,在濾池底部為硝化菌提供了生長環境,通過硝化菌的作用去除部分氨氮。試驗研究了水力停留時間、碳氮比和反沖洗條件對反硝化生物濾池的深度脫氮影響。結果表明:反硝化生物濾池具有較強耐水力沖擊負荷能力,當HRT大于或等于10min時,具有很好的反硝化效果,乙酸鈉濾池和乙醇濾池對NO_3~--N和TN的去除率相當,都能達到90%以上,葡萄糖濾池能達到80%以上。對于本試驗條件下,反硝化生物濾池以HRT為10min為最佳;
脫氮效果,乙醇\乙酸鈉\葡萄糖;以乙醇為碳源時的直接投加成本最低,其次是乙酸鈉、葡萄糖的直接投加成本最高;乙醇的安全性和風險防范要求較高,投加系統的建設和運行維護管理成本也會較高,而乙酸鈉、葡萄糖投加系統的維護管理較便利、成本低;葡萄糖濾池所需反沖洗的時間最長,電耗成本也最高;乙酸鈉作為反硝化生物濾池的外加碳源最經濟可行。