污水廠生化系統當進水碳源明顯不足時，必須外加碳源，碳源的選型非常重要，除小規模系統使用固體碳源外，目前絕大部分都在使用液體碳源，液體碳源不僅節省溶藥投資成本和人工成本，而且濃度均一，不存在濃度波動。介紹常用的液體碳源有乙酸鈉、葡萄糖、新型碳源，少數地方會選擇甲醇、乙酸。
液體乙酸鈉：COD當量在20萬左右（乙酸鈉的有效量在25%），含量繼續升高的情況下，會出現結晶現象。
液體葡萄糖：以食品級為主，COD當量在60萬左右，（單糖有效含量85%以上）
新型碳源：COD當量20萬-40萬之間，以小分子醇類、酸類復配。
生物質碳源：COD當量100萬左右，含有較多大分子物質。
四種類型碳源各有優劣勢：
反硝化速率：新型碳源≥乙酸鈉＞液體葡萄糖或生物質碳源
污泥產量：液體葡萄糖或生物質碳源≥乙酸鈉＞新型碳源
性價比：新型碳源＞液體葡萄糖或生物質碳源＞乙酸鈉
在安全性有保障的情況下，應優先選擇甲醇、乙酸，常用的碳源類型中，醇類產泥量最小，其次是酸類，再次是糖類或生物質碳源類。
活性污泥法工藝、低負荷系統，需要良好的污泥活性可以考慮使用葡萄糖類，反硝化濾池工藝應優先選擇新型碳源、乙酸鈉類，活性污泥法工藝、常規負荷系統可以考慮選擇新型碳源類，反硝化速率快，產泥量少。